Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP214P35658 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP214P35658 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms