Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR1BP28222 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms