Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCMT1P22061 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCMT1P22061 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCMT1P22061 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms