Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS1P17812 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms