Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAV1P15498 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAV1P15498 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAV1P15498 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAV1P15498 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAV1P15498 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAV1P15498 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAV1P15498 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms