Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2P10911 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCF2P10911 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCF2P10911 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCF2P10911 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms