Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms