Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms