Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB3O43889 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms