Protein–RNA interactions for Protein: O43823

AKAP8, A-kinase anchor protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP8O43823 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AKAP8O43823 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms