Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTSS1O43312 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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