Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms