Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QRK9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
J3QRK9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
J3QRK9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
J3QRK9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
J3QRK9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
J3QRK9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
J3QRK9 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3QRK9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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