Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms