Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms