Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.536e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 PUS10-206ENST00000602599 6366 ntTSL 1 (best)4.74□□□□□ -1.656e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 213.31□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt19.97■□□□□ 0.793e-9■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.493e-9■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 OAZ1-206ENST00000589739 657 ntTSL 218.07■□□□□ 0.483e-9■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 OAZ1-208ENST00000592727 726 ntTSL 215.16■□□□□ 0.023e-9■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.115e-6■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.115e-6■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 ABCC1-204ENST00000572882 4565 ntTSL 1 (best)10.17□□□□□ -0.785e-6■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 GALE-202ENST00000418277 882 ntTSL 517.37■□□□□ 0.373e-6■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 GALE-204ENST00000429356 957 ntTSL 513.43□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 F7-205ENST00000479674 767 ntTSL 523.5■■□□□ 1.354e-6■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 520.02■□□□□ 0.84e-6■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.34e-6■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.534e-6■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.654e-6■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 SLC16A3-212ENST00000581642 557 ntTSL 418.19■□□□□ 0.57e-8■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.897e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.767e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.747e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.747e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.557e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.527e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.347e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 217.01■□□□□ 0.317e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 416■□□□□ 0.157e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.257e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 312.38□□□□□ -0.437e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.444e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 NBR2-203ENST00000467245 1158 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.864e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 NBR2-201ENST00000356906 978 ntTSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.154e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 PCYT2-210ENST00000572473 575 ntTSL 520.92■□□□□ 0.946e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 PCYT2-215ENST00000573927 778 ntTSL 316.14■□□□□ 0.176e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 PCYT2-209ENST00000572157 442 ntTSL 411.75□□□□□ -0.536e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 RNF126-206ENST00000592626 652 ntTSL 218.7■□□□□ 0.582e-6■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 ITIH3-207ENST00000467268 568 ntTSL 413.27□□□□□ -0.292e-11■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 PLXNB1-209ENST00000466353 626 ntTSL 318.77■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 KLHDC10-202ENST00000463413 503 ntTSL 225.77■■□□□ 1.725e-10■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.585e-10■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 KLHDC10-203ENST00000468226 772 ntTSL 37.29□□□□□ -1.245e-10■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 SLC16A3-215ENST00000582946 586 ntTSL 417.08■□□□□ 0.321e-16■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.846e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 ALDH1A2-212ENST00000558595 484 ntTSL 39.7□□□□□ -0.863e-6■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 ABCC1-205ENST00000574224 1543 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.434e-6■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 PFKL-210ENST00000496824 1063 ntTSL 519.5■□□□□ 0.717e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 MSI2-210ENST00000579505 577 ntTSL 318.14■□□□□ 0.491e-8■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-8■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.161e-8■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 MSI2-207ENST00000579205 500 ntTSL 415.12■□□□□ 0.011e-8■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 MSI2-216ENST00000582772 398 ntTSL 34.17□□□□□ -1.741e-8■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 SLC16A3-209ENST00000580098 859 ntTSL 219.76■□□□□ 0.758e-8■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 DKC1-210ENST00000481062 819 ntTSL 212.75□□□□□ -0.372e-6■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 DKC1-209ENST00000475966 902 ntTSL 510.25□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 DKC1-204ENST00000426673 843 ntTSL 59.55□□□□□ -0.882e-6■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 RTEL1-202ENST00000356810 1339 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.064e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.264e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.264e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.364e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 ACIN1-206ENST00000473758 3540 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.574e-7■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 ATXN2L-212ENST00000564035 786 ntTSL 216.54■□□□□ 0.241e-6■■□□□ 12.4
RBM22Q9NW64 TMEM259-208ENST00000592052 1637 nt25.16■■□□□ 1.622e-15■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 TMEM259-210ENST00000592618 1877 ntTSL 525.13■■□□□ 1.612e-15■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.182e-15■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.962e-15■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.722e-15■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 TMEM259-205ENST00000586704 2538 ntTSL 518.23■□□□□ 0.512e-15■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 TMEM259-211ENST00000593068 1965 ntTSL 518.13■□□□□ 0.492e-15■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 TMEM259-204ENST00000586285 626 ntTSL 312.76□□□□□ -0.372e-15■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 SLC16A3-205ENST00000578574 958 ntTSL 223.84■■□□□ 1.416e-8■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.333e-9■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 GAPDH-209ENST00000492719 930 ntTSL 313.31□□□□□ -0.283e-9■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 GAPDH-208ENST00000474249 1333 ntTSL 513.05□□□□□ -0.323e-9■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.333e-9■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.483e-9■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.711e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.151e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 COL18A1-207ENST00000473212 2515 ntTSL 221.23■□□□□ 0.995e-6■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 XIAP-203ENST00000422098 390 ntTSL 424.16■■□□□ 1.466e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 XIAP-207ENST00000468691 764 ntTSL 519.39■□□□□ 0.696e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 XIAP-210ENST00000497640 533 ntTSL 1 (best)18.54■□□□□ 0.566e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 XIAP-211ENST00000497906 495 ntTSL 516.09■□□□□ 0.176e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 XIAP-208ENST00000481776 598 ntTSL 514.31□□□□□ -0.126e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 TRAPPC12-215ENST00000469147 1002 ntTSL 39.72□□□□□ -0.854e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.926e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.016e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.446e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 XIAP-204ENST00000430625 528 ntTSL 31.29□□□□□ -2.26e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.165e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.165e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.065e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.075e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.345e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)11.77□□□□□ -0.535e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 FASTKD1-203ENST00000445210 1850 ntTSL 28.96□□□□□ -0.988e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 FASTKD1-202ENST00000438035 1045 ntTSL 1 (best)6.18□□□□□ -1.428e-7■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 HP1BP3-209ENST00000437575 473 ntTSL 325.49■■□□□ 1.673e-17■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 HP1BP3-211ENST00000443615 557 ntTSL 321.3■■□□□ 13e-17■■□□□ 12.3
RBM22Q9NW64 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.743e-17■■□□□ 12.3
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