Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO5CQ9NQX4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms