Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms