Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CENPOQ9BU64 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms