Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NDFIP1Q9BT67 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms