Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHCHD6Q9BRQ6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms