Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TREX2Q9BQ50 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms