Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NABP2Q9BQ15 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms