Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP8Q99708 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP8Q99708 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms