Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms