Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPS6KC1Q96S38 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms