Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIC2Q96JB3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms