Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGCDQ92629 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGCDQ92629 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGCDQ92629 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGCDQ92629 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGCDQ92629 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGCDQ92629 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGCDQ92629 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGCDQ92629 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCDQ92629 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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