Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms