Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms