Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKAP1Q86WV1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms