Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC84Q86UT8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms