Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TMIGD1Q6UXZ0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD1Q6UXZ0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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