Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED9Q6R2W3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED9Q6R2W3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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