Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PERM1Q5SV97 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms