Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms