Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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