Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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