Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDO1Q16878 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDO1Q16878 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms