Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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