Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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NDUFA9Q16795 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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NDUFA9Q16795 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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NDUFA9Q16795 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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NDUFA9Q16795 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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