Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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