Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP6AP1Q15904 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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