Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NEDD8Q15843 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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