Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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