Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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NFIXQ14938 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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NFIXQ14938 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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NFIXQ14938 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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NFIXQ14938 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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NFIXQ14938 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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NFIXQ14938 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NFIXQ14938 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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