Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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