Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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