Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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