Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAD51Q06609 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms